Vi vil benytte selskapet SciFish Animalia til å implementere et omfattende utkrysningsprogram, avlsprogram og en vektet avlsindeks basert på egenskaper.
Dette vil i sum sikre at vi ivaretar de ønskede egenskapene til CKCS samtidig som vi forbedrer helsetilstanden og genetisk mangfold i populasjonen.
For å nå dette målet vil vi bruke moderne DNA-analyser og de verktøy som genetikere har til rådighet på en ny måte i forhold til tradisjonelle avlsmetoder.
Om tradisjonelle vs fremtidens avlsverktøy
Tradisjonell hundeavl har vært basert på det vi kan se eller undersøke på et lite antall hunder.
I tillegg har det blitt benyttet avlsverdier for noen tilstander, som for eksempel HD (hofteleddsdysplasi). Avlsverdier (eller indeksberegning) er kort sagt en beregning som gir en hund en tallverdi basert på hundens egen tilstand og slektningenes tilstand. Når to hunder pares bør samlet verdi delt på to bli bedre enn snittet på rasen hvis vi ønsker avlsfremgang.
DNA-tester brukes i dag av noen oppdrettere for å sjekke om en hund er fri, bærer eller affisert i forhold til en sykdom som uttrykkes ved ett bestemt gen. Det er imidlertid begrenset hvilke sykdommer man kan teste for og det er heller ikke alle tester som gjelder for alle raser. I tillegg er det mange tilstander/sykdommer som involverer mange gener, og disse har vi ikke slike DNA-tester for.
Vi kan også DNA-teste for å finne ut hvor innavlet en hund er. En slik test kan for eksempel vise hvor stor prosentandel av hundens DNA som er identisk både fra mor og far, altså prosentandelen homozygoti/innavl.
Det som er nytt, og som vi skal gjøre i dette prosjektet, er blant annet å benytte DNA i arbeidet med å finne frem til gode kombinasjoner av hannhunder og tisper av rasen CKCS og innkrysningshundene basert på moderne analysemetoder.
Det er nemlig mulig å benytte genomiske (DNA-baserte) avlsverdier for egenskaper og tilstander/sykdommer ved å DNA-teste en hund, og gi den en genomisk avlsverdi for en egenskap/tilstand/sykdom. Denne verdien er også basert på DNA-informasjon fra hundens slektninger og slektshistorikk. Ved å se på avlsverdien på to potensielle avlsdyr kan vi dermed forutsi risikoen for at avkom vil få eller ikke vil få en gitt egenskap/tilstand eller sykdom.
Dette kan gjøres uten at vi vet nøyaktig og i detalj hvilke gener som styrer egenskapen/tilstanden/sykdommen, fordi vi kan sammenligne en hund sitt DNA med DNA fra hunder som ikke har samme egenskap/tilstand/sykdom (en referansegeruppe).
Dette er avlsverktøy som er i bruk på andre arter, og som vi nå ønsker å introdusere også i hundeavlen.
DNA-analyse og genotyping
For hvert individ i avlsprogrammet vil SciFish Animalia hente ut DNA, genotype og analysere dataene.
Over tid vil dette gjøre det mulig å få en dypere forståelse av genetisk innavl. Disse analysene gir oss en dypere forståelse av den genetiske variasjonen i populasjonen og gjør det mulig å ta informerte beslutninger i avlsarbeidet.
Genomisk seleksjon og avlsverdier
Ved å bygge opp en referansepopulasjon med genotyper (DNA) og fenotyper (data på det som uttrykkes/som vi kan observere) for de relevante egenskapene, kan SciFish Animalia på sikt utarbeide avlsverdier (EBV) gjennom genomisk seleksjon (GS).
Dette innebærer at avlsverdien for hver egenskap kan forutsies med høy presisjon, noe som er viktig for å oppnå de avlsmålene vi har satt.
Registrering av slektskapshistorikk
For å øke nøyaktigheten og effektiviteten av avlsprogrammet, vil vi samle inn så mye informasjon som mulig om foreldre, besteforeldre og søsken til prosjekthundene.
Et skjema for registrering av individinformasjon vil bli utsendt til alle deltakerne, og dataene vil bli lagret i SciFish Animalias tabeller og database. Dette vil på sikt gi et omfattende datagrunnlag som er nødvendig for å drive et vellykket avlsprogram og sikre langsiktig genetisk helse og mangfold i CKCS-populasjonen.
